Первое торжественное открытие отделения прошло 11 декабря 1987 года. Так, на базе Республиканской больницы № 1, как специализированное, детское, хирургическое отделение открыто отделение на 35 коек.
В те годы организация отделения произошла благодаря усилиям главного хирурга Министерства здравоохранения РТ Лидии Козловой, заведующего хирургическим отделением Александра Канунникова, заведующей кафедрой детской хирургии, профессора, доктора медицинских наук Красноярского государственного медицинского университета г. Красноярска Валентины Красовской.
До открытия отделения хирургическая помощь детскому населению оказывалась на базе взрослого, хирургического отделения. С 1962 года по 1970 гг. работал детский хирург Игорь Кашлаев. Первой заведующей отделением была назначена Наталья Вениаминовна Беспалова, выпускница клинической ординатуры на базе кафедры детской хирургии 2 МОЛГМИ им. Н. И. Пирогова.
Чистота и уют в отделении поддерживается напряженной работой младших медицинских сестер и санитарок, таких как Пичи-оол А. Ф., Маады А. Д., Монгуш С. Ч., Окпан-оол О. О., Ооржак О. К. под руководством сестры-хозяйки отделения Сандан Р. Ч. Лечебное питание детей в отделении обеспечивается терпеливым трудом санитарок-буфетчиц Ооржак А-С. А., Шавылдай М. Б.
Лечебно-диагностическим процессом, слаженной работой отделения по оказанию специализированной хирургической помощи детям руководит заведующая отделением врач детский хирург высшей категории Чойгана Саая и старшая сестра отделения Чодураа Куулар.